在精液液化的过程中，精囊和前列腺有不同的分工，精囊主要负责凝固精液，而前列腺负责液化精液，如果前列腺或精囊出现了不协调，就会导致精液液化的异常。
90%的精液不液化患者存在前列腺功能障碍，其中最多见的原因是前列腺炎，造成溶解酶分泌减少，出现不液化。另外，精索静脉曲张等疾病可引起睾丸内分泌功能失调，睾酮分泌减少，导致附属性腺(包括前列腺、精囊腺等)分泌功能的减低，也会形成精液不液化现象，从而影响精子的活力。当前列腺或精囊腺发生炎症时，由于蛋白水解酶的分泌缺乏或破坏，造成酶系统的失调，使得一些患者的精液放置1小时也不液化，或者液化不全，粘稠度太高。这就称之为精液不液化，是一种病理现象。在这种情况下，精子无法移行，自然会造成不育。
因此，精囊腺炎症和前列腺疾病是引起不液化的重要原因。不过，临床上一些前列腺炎患者并无液化异常的现象，可能是由于这些患者精囊腺分泌活动减低，使凝固和液化的作用达到了新的平衡状态。
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